La 20th Century Fox ha iniziato i negoziati con Chris Carter e Frank Spotnitz per la messa in opera di un secondo film di X-Files. Tuttavia è pacifico che il film non uscirà che fra molto tempo, nè il regista ne il cast sono stati ancora convocati, e il progetto intero è ancora allo stato embrionale. Variety nota che nonostante la sua dipartita dal telefilm settimanale, David Duchovny rimane disponibile alla ripresa del ruolo di Fox Mulder per il Film. Il comunicato aggiunge anche che Gillian Anderson ritornerà: i dubbi riguardano il fatto se la storia sarà autonoma oppure profondamente immersa nella mitologia del telefilm come lo era il primo film. Se le cose andranno come previsto le riprese inizieranno nel 2002 ed il film dovrebbe uscire per il Natale del 2003.